長野県は、我が国の中央部に位置し、日本の屋根ともいわれ諸山岳が連なっている。これらの山岳を源として千曲川・犀川・天竜川・木曽川が流れ、この千曲川の流域には佐久平と善光寺平が、犀川の流域には松本平が、天竜川の流域には伊那平が、そして木曽川の流域には木曽路がそれぞれひらけ、また諏訪湖を中心に諏訪盆地がひらけています。
　この長野県の中央部、松本平の中心に位置する松本空港は、昭和40年7月に信州の空の玄関として供用を開始しました。翌昭和41年8月から｢アルプスの空の旅｣として観光 臨時便が大阪−松本間に就航し、その後通年運航定期便、さらに、通年複便が就航しました。
　この間、航空機の一層の安全を確保するため、航空保安無線施設穂高NDB、松本VOR／DME、進入角指示灯等の設置など、逐次充実を図ってきました。
　またジェット化対応可能な空港とするため、滑走路拡張工事(1500m→2000m)を、平成4年1月から開始し、平成6年4月に完成しました。
　平成6年7月の供用開始時には、(株)日本エアシステムのDC-9-87(MD-87)型機が大阪、福岡及び札幌に就航し、松本空港はジェット化空港としての第一歩を踏みだしました。
　平成10年6月には、日本エアコミューター(株)のSAAB340B型機が新規路線として松山（〜13年6月）及び高松（〜11年5月）に就航し、同年9月には、ジェット化開港以来の利用客が100万人に達しました。
　平成13年4月から日本エアコミューター(株)のYS-11型機が大阪に就航(〜13年10月）し 、同年5月にはジェット化開港以来の利用客が150万人に達しました。
　しかしながら、利用客数は、平成8年度の約26万人をピークに年々減少傾向にあることから、平成13年10月、有識者等で構成する「松本空港活性化検討委員会」を設置し、平成14年11月に「松本空港活性化に向けての提言」をとりまとめ、活性化に向けて更に取り組むこととしました。
　この間、平成14年10月には、日本航空（株）と（株）日本エアシステムが統合され（株）日本航空ジャパンが設立されました。
　平成15年4月から、日本エアコミューター（株）のＤＡＳＨ-8-400型機が大阪線に就航しました。
　平成16年4月からは、福岡線においても日本エアコミューター（株）のＤＡＳＨ-8-400型機で運航し、同年7月には、愛称「信州まつもと空港」の使用を開始しました。同じく7月にはジェット化開港以来の利用客が200万人に達しました。
　平成17年3月には、初の海外からの国際チャーター便（香港⇔松本）が運航されました。
　平成19年4月には、開港以来の利用者が300万人を達成しました。同年9月をもって、ジェット化開港以来就航してきたDC-9-87(MD-87)型機が退役となりました。同年10月からは札幌線が 日本エアコミューター（株）のＤＡＳＨ-8-400型機による週４便の運航に、また、福岡線が週３便の運航となりました。
　平成22年５月末をもってＪＡＬが撤退し、６月からフジドリームエアラインズ（ＦＤＡ）が「まつもと空港」に就航し、最新鋭のジェット機で、札幌線と福岡線が毎日運航されました。